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Existem atualmente 03 Grupos de Pesquisa associados ao PCF, aos quais estão vinculados os projetos desenvolvidos no Programa:
1) Grupo de Pesquisa em Prospecção de Microrganismos e Substâncias Bioativas com Aplicação em Saúde (GPPMSBAS)
Líder: Profa. Dra. Rita de Cássia Garcia Simão
2) Grupo de Pesquisa em Ciência e Tecnologia de Alimentos (GPCTA)
Líder: Profa Dra Luciana Oliveira de Fariña
3) Grupo de Pesquisa em Fármacos e Medicamentos (GPFM)
Líder: Prof. Dr. Eduardo Borges de Melo