Atualmente, a infraestrutura física de laboratórios de pesquisa do Programa de Pós-graduação em Engenharia Química conta com 3 laboratórios, os quais são de uso exclusivo do PEQ-Unioeste, e uma Central Analítica Multiusuário.
Laboratório de Controle de Poluição - LCP
Laboratório de Processos de Biotecnológicos e de Separação – LBPS
Laboratório de Interdisciplinar de Tecnologias Ambientais – LITA