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La Universidad comenzó en 1994, como la confederación de Facultades municipales que se crearon en Cascavel (FECIVEL, 1972), Foz do Iguaçu (FACISA, 1979), Marechal Cândido Rondon (FACIMAR, 1980) y Toledo (FACITOL, 1980). En 1998, la Facultad municipal de Francisco Beltrão (FACIBEL) fue incorporado en Unioeste. En el año 2000, el Hospital Regional de Cascavel fue transformado en el Hospital Universitario del Oeste de Paraná – HUOP y trasladado a Unioeste. Desde 1994, Unioeste se ha convertido rápidamente en la universidad más importante de toda la región oeste y suroeste del Paraná. La consolidación y fuerte expansión de la institución a través de la creación de más de 65 programas de postgrado se produjo como resultado del fuerte trabajo en las áreas de enseñanza, investigación, divulgación e innovación a través de un desempeño destacado de nuestros profesores, personas de apoyo de la administración, estudiantes y directores. Hoy en día, Unioeste concentra el mayor capital intelectual del área, con la disposición de una gigantesca infraestructura tecnológica y laboratorial para satisfacer las demandas de una sociedad dinámica.